中乙：2006年-2007年
编辑
上海东亚足球俱乐部由上海东亚（集团）有限公司和上海根宝足球俱乐部基地有限公司共同出资在2005年12月25日成立，由中国著名的上海本土教练徐根宝担任公司董事长和俱乐部主席。由于“打造中国的曼联”一直是徐根宝的口号和奋斗目标，所以球队有时也会被戏称为“中国曼联”[6]。俱乐部是以根宝足球基地作为球队的基础，球员是由原上海根宝足球基地的球员组成。
2006年，上海东亚首次参加职业联赛，在当年的中国足球乙级联赛取得南区第七名。
2007年，上海东亚被分到该年中乙联赛的北区。然而东亚以9胜3平2负的成绩取得北区第一名，并在决赛阶段先后战胜安徽九华山与四川队，最终夺得了乙级联赛的冠军，成功升入中甲。
中甲：2008年-2012年
编辑
2008年，升入中甲后，球队将主场设在上海地区第二个专业足球场金山足球场，首次参加中甲的东亚队最终取得了第六名。
2009年，东亚的主场搬到了上海观众容量最大的八万人体育场。由于要为年中的全运会做准备，该年东亚队仍未引进内外援，继续以全华班出战中甲。2009年8月1日，以上海东亚为班底组成的上海队在决赛中以3比0战胜广东队，夺得了第十一届全运会足球比赛男子甲组的金牌[7]。然而中甲联赛中，东亚队却在一度占据冲超领先地位的情况下未能成功升级，最终排名第四。
在2010年中甲联赛开始之前，俱乐部提出了“冲超”的目标[8]，首次引进三名外援[9]，并由范志毅接任主教练，但最终只取得第四名未能成功“冲超”，赛季结束后范志毅向上海东亚提出辞呈，徐根宝重新任命蒋炳尧执掌球队，并出售3名主力球员以筹措资金，其中队长王佳玉和姜至鹏转会至南昌衡源[10]，副队长张琳芃转会至广州恒大[11]。另外，在上海市体育局的协调下，上海东亚和上海浦东中邦进行战略合作，中邦的优秀球员优先转会至东亚。同时由中邦来承担以东亚梯队球员为主的十二运男足甲组球队的全运会备战任务，并以上海中邦的名义在2011赛季征战乙级联赛。2010年11月，上海东亚首回合主场4-1，次回合客场2-1，两回合总比分5-3击败香港球队公民，获得沪港杯冠军。
2011年联赛开始前，中场主力曹赟定转会至同城的中超球队上海申花[12]，而门将顾超转会至杭州绿城[13]。 最终失去多名主力的球队整个赛季表现不佳，最终只获得第九名[14]。2011年11月，上海东亚首回合客场3-2，次回合主场7-1，两回合总比分10-3击败香港球队和富大埔，获得沪港杯冠军。
2012年联赛开始前，上海东亚以3年3000万元的价格将冠名权出售给中邦集团，球队以中邦集团旗下特莱士红酒命名，名称更改为上海特莱士队，而上海东亚作为俱乐部名称仍然予以保留[15]。赛季开始前，王云龙转会至江苏舜天[16]。十五轮后，东亚队以领先第二名湖南浏阳河七分的优势获得半程冠军。然而此时陷入降级泥潭的同城中超球队上海申花希望向东亚租借主力后卫柏佳骏，虽然起初遭到了东亚俱乐部的反对，但在申花投资人朱骏的请求和徐根宝出于上海足球大局考虑亲自劝说下，柏佳骏终于同意租借加盟上海申花，租期至至2012赛季末[17]，租借费为零[18]。放走柏佳骏后，东亚队的联赛成绩有所下滑，但好在众多冲超竞争对手也在此阶段相继失分，东亚仍然保住了第一的位置。2012年9月29日，上海东亚客场3比0战胜哈尔滨毅腾后，提前三轮冲超成功。[19] 10月20日，东亚在主场1比0战胜北京理工，提前一轮夺得中甲冠军。2012年11月，上海东亚首回合客场4-0，次回合主场3-2，两回合总比分7-2击败香港球队杰志，获得沪港杯三连冠。
中超：2013年－
编辑
2012年12月27日，上海东亚冲超成功，为充分整合上海足球资源，经根宝和中邦协商收回整队。[20]与此同时，中邦集团决定彻底告别中国足球，包括无条件终止和东亚的三年合作协议，让中邦全运队无条件回归东亚。[21]2012年12月28日，上海东亚足球俱乐部得到了上港集团的冠名赞助。2013赛季，上海东亚足球俱乐部以“上海上港集团足球队”的名义，征战中超联赛。[22]2012年12月21日，奚志康进入上海东亚足球俱乐部教练组，协助总教练徐根宝工作。[23]2013年2月27日上午，上港集团队召开新赛季首个新闻发布会，确认了高洪波为上港队新赛季的主教练。[24]同时徐根宝宣布：出于对同城球队的帮助，柏佳骏"重回申花怀抱"。[25]最终在2013年中超联赛中，上海东亚以第9名的成绩完成了中超处子赛季。
2013年9月10日，由上海东亚预备队球员为班底组成的上海队在决赛中加时赛1比0战胜东道主辽宁队，夺得第十二届全运会男足甲组金牌，成为第一支全运会男子足球项目实现连冠的球队。
2013年11月，上海东亚首回合主场2-1，次回合客场0-1，两回合总比分2-2战平，加时赛无果，在最终点球大战中以7：6击败香港球队南华，将沪港杯留在了上海，实现四连冠。
2013赛季结束，上港集团提出2014年新赛季争取中超前三，冲击亚冠名额的目标[26]。2014赛季初，上海上港用孙凯、吴毅臻、张文涛3名潜力球员换回当时尚在同城球队上海申鑫的原东亚队球员王佳玉，转会不涉及到转会费[27]。赛季前四轮，上港队凭借战平辽足，连续战胜申鑫、建业和贵州，取得新赛季前四轮连续不败的记录，首次登上积分榜首位。至第五轮开始，战绩趋于平稳，赛季上半程以六胜五平三负的战绩，暂位列联赛第六名。赛季下半程开始，上港队表现稳定，自第十七轮开始，一直占据积分榜第四，直至第二十五轮，上海上港主场以1比2的比分不敌竞争对手广州富力，从而跌落到联赛第五的位置，从此失去争夺亚冠名额的主动权。[28]赛季最后的五场比赛，由于相继被贵州人和、山东鲁能、哈尔滨毅腾逼平，无法在积分榜上重回前四位置，冲击亚冠名额宣布失败，最终以联赛第五名的成绩收官。
2014年11月，上海东亚首回合主场6-1，次回合客场0-0，两回合总比分6-1击败香港球队杰志，最终连续第五次获得沪港杯的冠军。
2014年11月18日下午，上港集团足球俱乐部成立仪式在上海国际客运中心“一滴水”举行，正式宣告上港集团完成了对上海东亚足球俱乐部的整体收购。仪式上，上海副市长赵雯与上港集团董事长陈戌源共同为上港足球俱乐部揭牌，标志着上港足球俱乐部正式成立。新闻发布会上，上港集团足球俱乐部宣布瑞典籍名帅埃里克森为球队新一任主教练，中方教练为奚志康，聘请徐根宝为俱乐部总顾问。
上海上港队在2015赛季初期喊出了争夺联赛冠军的口号，接连签下了新援为球队补充，包括了从贵州人和以5000万人民币签下了国脚于海，然后又签下了前广州恒大球员孔卡。赛季初期一度占据了中超榜首的位置，直到赛季末段，球队替补深度不足，伤病接连发生，失去了榜首位置。赛季倒数第二轮广州恒大淘宝队遭到山东鲁能泰山队的越位球扳平错失了提前夺冠的机会，上港将冠军悬念保持到了最后一轮，直到广州恒大对最后一轮以2-0击败北京国安，夺取了中超冠军。
2016赛季，上港队依旧以争夺冠军作为自己的主要目标，从广州恒大引进了前锋埃尔克森。最终，在倒数第二轮反超同城对手上海绿地申花排名联赛第三。
2017赛季，上港队在主力框架未有变动的情况下，先后引进了奥斯卡、艾哈迈多夫、里卡多·卡瓦略等实力外援，并喊出了要三线争冠的口号。结果，由于赛季中主力球员频繁遭到足协禁赛[29][30]，上港队仍旧未能打破广州恒大淘宝队对中超的垄断。在亚冠赛场上，上港队在淘汰赛第一轮击败近况不佳的国内球队江苏苏宁；在第二轮淘汰赛中，上港队在首回合4-0领先的大好局面下，险些被广州恒大淘宝队在主场逆转，最终依靠在点球大战中的表现惊险晋级；在半决赛中，上港队以两回合1:2的比分，不敌J联赛霸主浦和红钻，止步四强，但也获得了队史亚冠最好成绩。在足协杯赛场上，上港队一路披荆斩棘杀入决赛，却在被一致看好的情况下因客场进球劣势不敌同城死敌上海绿地申花，再次屈居亚军。
2018赛季，在2018年11月3日进行的联赛第28轮中，位于榜首的上海上港以5:4的比分赢下了与位于积分榜次席的广州恒大淘宝的天王山之战，在联赛还剩两轮的情况下领先后者五分[31]。在2018年11月7日，上海上港在主场击败北京人和后，以29战积68分的成绩，提前一轮获得2018年中超联赛冠军。上港队在获得队史第一座顶级联赛冠军的同时，也打破了广州恒大淘宝队对中超冠军长达7年的垄断[32]。
2019赛季，上港在送走当家射手王武磊去西班牙人之后未被看好卫冕。不过他们在赛季初凭借王燊超和吕文君的进球2-0战胜国安获得2019年超级杯，联赛也获得开局连胜。但是在夏季引进外援阿瑙托维奇之后却在后来的数轮比赛中未能获得任何胜利。亚冠也在战胜全北后在八强中再次败给浦和红钻草草收场。足协杯更是在半决赛0-2败于少打一人的山东鲁能，最终上港仅仅获得赛季中超的第三名。
2020赛季，上港在赛季开始前引进了巴西外援洛佩兹，赛季初段照常打出连胜。在赛季中期将艾哈迈多夫卖给天津泰达后引进同样属于中场的亚足协外援阿隆.穆伊。最终赛季排名第四。
2021年1月12日，上海上港宣布更名为上海海港足球俱乐部以符合足协俱乐部名称中性化的要求[33]。同年中超依旧实行赛会制，上港在第二阶段争冠组获得亚军，后又在足协杯决赛负于山东泰山，继2017赛季后第二次离冠军奖杯一步之遥。
2022年1月4日，2021赛季中超第二阶段第22轮，海港1-0击败广州队，反超对手获得亚军。1月9日，足协杯决赛，海港0-1负于山东泰山，居于亚军。同年6月开赛的2022赛季，球队状态受上海疫情封控影响，赛季初期体能状态不佳，备战时间缩短，排名一度跌出亚冠区。赛季后期负于河南队后主教练莱科下课，由奚志康代理主教练至赛季结束。最终上海海港获得赛季第四名以及亚冠附加赛资格，且在联赛32轮对阵山东泰山取得2-0的胜利，阻止对方卫冕中超冠军。
2023赛季，上海海港在联赛中期一度领先第二名16分，但在赛季末期频繁丢分，致使冠军归属悬念一直留存到倒数第二轮。2023年10月29日，手握五分优势的上海海港在主场1比1战平积分榜次席山东泰山，提前一轮夺得2023赛季中超冠军[34]。在赛季后期，由于球队状态下滑以及重要比赛的失利，上海海港队的主教练哈维尔受到了多方批评。尽管他带队赢得中超联赛冠军，但球队在足协杯早早出局，亚冠资格赛更是意外不敌泰国球队巴吞联，无缘正赛。这些表现引发了外界对哈维尔战术设计、外援使用等方面的广泛质疑。赛季结束后，上海海港俱乐部宣布不与哈维尔续约，双方正式分道扬镳[35]。
2024赛季，海港队迎来了新任主帅凯文·马斯凯特[36]。2024年7月21日，上海海港主场5比0战胜青岛海牛，追平中超此前保持的最长的13连胜纪录[37]。7月26日，上海海港又战胜南通支云，创下14连胜，打破中超的连胜纪录[38]。8月17日，十人上海海港客场1:3不敌位列积分榜次席的同城球队上海申花，分差被缩小至2分的同时，连胜纪录终止于16场。受多线作战、伤病等因素的影响，球队在赛季后半段状态欠佳，一度在倒数第三轮被上海申花反超。在倒数第二轮，上海海港客场一球小胜沧州雄狮，而上海申花主场被升班马深圳新鹏城逼平，上海海港得以重返榜首。随着最后一轮主场5球大胜天津津门虎，上海海港以30轮78分，力压同城对手上海申花卫冕中超冠军。在实现卫冕的同时，球队也创下多项纪录，包括联赛积分（30轮制）[39]、联赛连胜场次数[40]、进球数、净胜球数[41]，球队前锋武磊也以34个联赛进球刷新了由扎哈维保持的单赛季中国顶级联赛进球纪录[42]。在同年11月23日进行的足协杯决赛中，上海海港又以3:1的比分击败山东泰山，夺得了队史首个足协杯冠军。上海海港队成为了继山东泰山、大连实德和广州队之后，又一支双冠王（即同一年夺得联赛、杯赛双冠）球队[43]。